2-tert-butyl-7-(diethylamino)-4-[3-(1-{6-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-6-oxohexyl}-3,3-dimethyl-5-sulfonato-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl]-1λ4-chromen-1-ylium

• ChemBase编号: 157957
• 分子式: C40H49N3O8S
• 平均质量: 731.89736
• 单一同位素质量: 731.32403654
• SMILES: CCN(CC)c1ccc2c(cc([o+]c2c1)C(C)(C)C)/C=C/C=C\1/C(c2cc(ccc2N1CCCCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O)S(=O)(=O)[O-])(C)C
• Canonical SMILES: CCN(c1ccc2c(c1)[o+]c(cc2/C=C/C=C/1\N(CCCCCC(=O)ON2C(=O)CCC2=O)c2c(C1(C)C)cc(cc2)S(=O)(=O)[O-])C(C)(C)C)CC
• InChI: InChI=1S/C40H49N3O8S/c1-8-41(9-2)28-17-19-30-27(24-35(39(3,4)5)50-33(30)25-28)14-13-15-34-40(6,7)31-26-29(52(47,48)49)18-20-32(31)42(34)23-12-10-11-16-38(46)51-43-36(44)21-22-37(43)45/h13-15,17-20,24-26H,8-12,16,21-23H2,1-7H3
• InChIKey: PHHUECZJTSYKRH-UHFFFAOYSA-N

名称和登记号

名称

• IUPAC标准名: 2-tert-butyl-7-(diethylamino)-4-[3-(1-{6-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-6-oxohexyl}-3,3-dimethyl-5-sulfonato-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl]-1λ^4-chromen-1-ylium
• IUPAC传统名: 2-tert-butyl-7-(diethylamino)-4-[3-(1-{6-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy]-6-oxohexyl}-3,3-dimethyl-5-sulfonatoindol-2-ylidene)prop-1-en-1-yl]-1λ^4-chromen-1-ylium
• 别名: 荧光红 HFG 激活剂; 荧光红 HFG 活性剂; Reactive fluorescent red 630; Fluorescent red 630 reactive

登记号

• CAS号: 350496-73-0
• MDL号: MFCD03456833
• PubChem SID: 162252093; 24887291
• PubChem CID: 11664869

理论计算性质

• Acid pKa: -3.3883724
• 质子受体: 9
• 质子供体: 0
• LogD (pH = 5.5): 5.34853
• LogD (pH = 7.4): 5.3485003
• Log P: 5.096688
• 摩尔折射率: 213.9174 cm^3
• 极化性: 78.843834 Å^3
• 极化表面积: 140.5 Å^2
• 可自由旋转的化学键: 15
• 里宾斯基五规则: false

分子性质

理化性质

• 溶解度: DMF: soluble
• 荧光: λex 620 nm; λem 650 nm in 0.1 M phosphate pH 7.0

安全信息

• 德国WGK号: 3
• 个人保护装置: Eyeshields, Gloves, type N95 (US), type P1 (EN143) respirator filter
• 保存温度: -20°C

产品相关信息

• 纯度: ≥80% (coupling to amines)
• 级别: for fluorescence
• Empirical Formula (Hill Notation): C40H49N3O8S

详细说明

Sigma Aldrich - 78361

Application
由红色激光（633nm 氦氖激光）和二极管激光 (635-650nm) 激活的氨基活性生物标记物。发色团为桥联半花青。水相中量子产量极低，但将其连接至目标蛋白后，量子产量增加多达一个数量级；摩尔吸光系数为 120,000M-1 cm-1，λabs：（偶联物）645nm；λem：（偶联物）660nm
Features and Benefits
这种新型血蓝蛋白染料最好用 633nm 氦氖激光激活，但也可以通过 647nm 氩激光或氩氪激光或者二极管激光激活。其他优点包括：高摩尔吸光系数 (120,000M-1cm-1)在非水介质中量子产率低，但将其键合至目标分子后，量子产率激增。固态具有极强荧光，可用于在玻璃上制备 DNA 阵列。