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相似度(0~1)：
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0.9
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0.6
0.5
0.4
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0.2
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结构相似度/功能相似度 比例（0~1）：
1
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0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
Part I: 碳原子 Carbon
- I.1: 碳-碳键 Carbon-Carbon Bonds
- I.1.1 烷烃 Alkanes
- 伯碳原子 Primary carbon
- 仲碳原子 Secondary carbon
- 叔碳原子 Tertiary carbon
- 季碳原子 Quaternary carbon
- I.1.2 碳-碳双键和三键 C-C double and Triple Bonds
- 烯烃 Alkene
- 炔烃 Alkyne
- 累积二烯烃 Allene
- I.2: 含一个碳-杂键 One Carbon-Hetero Bond
- I.2.1 卤代烃 Alkyl Halogenides
- 氯代 Alkylchloride
- 氟代 Alkylfluoride
- 溴代 Alkylbromide
- 碘代 Alkyliodide
- I.2.2 醇和醚 Alcohols and Ethers
- 醇 Alcohol
- 伯醇 Primary alcohol
- 仲醇 Secondary alcohol
- 叔醇 Tertiary alcohol
- 二烷基醚 Dialkylether
- 二烷基硫醚 Dialkylthioether
- 烷基芳基醚 Alkylarylether
- 二芳基醚 Diarylether
- 烷基芳基硫醚 Alkylarylthioether
- 二芳基硫醚 Diarylthioether
- 氧鎓盐 Oxonium
- I.2.3 胺类 Amines
- 胺 Amine
- 脂肪伯胺 Primary aliphatic amine
- 脂肪仲胺 Secondary aliphatic amine
- 脂肪叔胺 Tertiary aliphatic amine
- 脂肪季铵盐 Quaternary aliphatic ammonium
- 芳香伯胺 Primary aromatic amine
- 芳香仲胺 Secondary aromatic amine
- 芳香叔胺 Tertiary aromatic amine
- 芳香季铵盐 Quaternary aromatic ammonium
- 混合仲胺 Secondary mixed amine
- 混合叔胺 Tertiary mixed amine
- 混合季铵盐 Quaternary mixed ammonium
- 铵盐 Ammonium
- I.2.4 其他含一个碳杂键 Others
- 巯基 Alkylthiol
- 二烷基硫醚 Dialkylthioether
- 烷基芳基硫醚 Alkylarylthioether
- 二硫化物 Disulfide
- 1,2-氨基醇 1,2-Aminoalcohol
- 1,2-邻二醇 1,2-Diol
- 1,2-偕二醇 1,1-Diol
- 氢过氧化物 Hydroperoxide
- 过氧化物 Peroxo
- 有机锂化合物 Organolithium compounds
- 有机镁化合物 Organomagnesium compounds
- 金属有机化合物 Organometallic compounds
- I.3: 含两个碳-杂键（羰基及衍生物） Two Carbon-Hetero Bonds (Carbonyl and Derivatives)
- I.3.1 碳-杂双键 Double Bond to Hetero
- 醛 Aldehyde
- 酮 Ketone
- 硫醛 Thioaldehyde
- 硫酮 Thioketone
- 亚胺 Imine
- 亚胺盐 Immonium
- 肟 Oxime
- 肟醚 Oximether
- I.3.2. 两个碳-杂单键 Two Single Bonds to Hetero
- 缩醛 Acetal
- 半缩醛 Hemiacetal
- 缩醛胺 Aminal
- 半缩醛胺 Hemiaminal
- 硫缩醛 Thioacetal
- 硫半缩醛 Thiohemiacetal
- 卤代缩醛 Halogen acetal like
- 其他类缩醛 Acetal like
- 卤代甲基醚 Halogenmethylen ester and similar
- 氮、氧、硫代甲基醚 NOS methylen ester and similar
- 其他杂代甲基醚 Hetero methylen ester and similar
- 羟腈 Cyanhydrine
- I.3.3 两个碳-杂键接碳-碳双键（类似烯醇） Single Bond to Hetero, C=C Double Bond (Enols and Similar)
- 氯代烯烃 Chloroalkene
- 氟代烯烃 Fluoroalkene
- 溴代烯烃 Bromoalkene
- 碘代烯烃 Iodoalkene
- 烯醇 Enol
- 烯二醇 Endiol
- 烯醇醚 Enolether
- 烯醇脂 Enolester
- 烯胺 Enamine
- 烯硫醇 Thioenol
- 烯硫醚 Thioenolether
- I.4: 含三个碳-杂键（羧基衍生物） Three Carbon-Hetero Bonds (Carboxyl and Derivatives)
- 酰氯 Acylchloride
- 酰氟 Acylfluoride
- 酰溴 Acylbromide
- 酰碘 Acyliodide
- 酰卤 Acylhalide
- 羧酸 Carboxylic acid
- 羧酸酯 Carboxylic ester
- 内酯 Lactone
- 酸酐 Carboxylic anhydride
- 羧酸衍生物 Carboxylic acid derivative
- 硫代羧酸 Carbothioic acid
- 硫代羧酸(硫)酯 Carbothioic S ester
- 硫代羧酸(硫)内酯 Carbothioic S lactone
- 硫代羧酸(氧)酯 Carbothioic O ester
- 硫代羧酸(氧)内酯 Carbothioic O lactone
- 硫代羧酸酰卤 Carbothioic halide
- 二硫代羧酸 Carbodithioic acid
- 二硫代羧酸酯 Carbodithioic ester
- 二硫代羧酸内酯 Carbodithiolactone
- 酰胺 Amide
- 伯酰胺 Primary amide
- 仲酰胺 Secondary amide
- 叔酰胺 Tertiary amide
- 内酰胺 Lactam
- 烷基酰亚胺 Alkyl imide
- 氮杂酰亚胺 N hetero imide
- 酰亚胺(酸性) Imide acidic
- 硫代酰胺 Thioamide
- 硫代内酰胺 Thiolactam
- 肟酯 Oximester
- 脒(不属于芳香环一部分) Amidine
- 羟肟酸 Hydroxamic acid
- 羟肟酸酯 Hydroxamic acid ester
- 亚氨酸 Imidoacid
- 环亚氨酸 Imidoacid cyclic
- 亚氨酸酯 Imidoester
- 亚氨酸内酯 Imidolactone
- 硫代亚氨酸 Imidothioacid
- 硫代环亚氨酸 Imidothioacid cyclic
- 硫代亚氨酸酯 Imidothioester
- 硫代亚氨酸内酯 Imidothiolactone
- 脒(非(硫代)羰基取代且不属于环结构) Amidine
- 亚氨酸内酰胺 Imidolactam
- 亚氨酸酰卤 Imidoylhalide
- 环亚氨酸酰卤 Imidoylhalide cyclic
- 氨基腙 Amidrazone
- Alpha-氨基酸 Alpha aminoacid
- Alpha-羟基酸 Alpha hydroxyacid
- 肽键 Peptide middle
- 多肽碳端 Peptide C term
- 多肽氮端 Peptide N term
- 原羧酸酯 Carboxylic orthoester
- 烯酮 Ketene
- 烯醛 Ketenacetal
- 腈 Nitrile
- 异腈 Isonitrile
- 共轭羰基及衍生物 Vinylogous carbonyl or carboxyl derivative
- 共轭羧酸 Vinylogous acid
- 共轭羧酸酯 Vinylogous ester
- 共轭酰胺 Vinylogous amide
- 共轭酰卤 Vinylogous halide
- I.5: 含四个碳-杂键（碳酸衍生物） Four Carbon-Hetero Bonds (Carbonic Acid and Derivatives)
- 碳酸二酯 Carbonic acid dieester
- 碳酸脂酰卤 Carbonic acid esterhalide
- 碳酸单酯 Carbonic acid monoester
- 碳酸衍生物 Carbonic acid derivatives
- 硫代碳酸二酯 Thiocarbonic acid dieester
- 硫代碳酸脂酰卤 Thiocarbonic acid esterhalide
- 硫代碳酸单脂 Thiocarbonic acid monoester
- 脲 Urea
- 硫脲 Thiourea
- 异脲 Isourea
- 异硫脲 Isothiourea
- 胍 Guanidine
- 氨基甲酸 Carbaminic acid
- 氨基甲酸酯 Urethan(Carbamate ester)
- 缩二脲 Biuret
- 氨基脲 Semicarbazide
- 碳酰肼 Carbazide
- 缩氨基脲 Semicarbazone
- 缩（对称）二氨基脲 Carbazone
- 氨基硫脲 Thiosemicarbazide
- 硫代卡巴肼 Thiocarbazide
- 缩氨基硫脲 Thiosemicarbazone
- 硫卡巴腙 Thiocarbazone
- 异氰酸酯 Isocyanate
- 氰酸酯 Cyanate
- 异硫氰酸酯 Isothiocyanate
- 硫氰酸酯 Thiocyanate
- 碳二亚胺 Carbodiimide
- 原碳酸衍生物 Orthocarbonic derivatives
- I.6 芳香族 Aromatics
- 酚 Phenol
- 邻二酚 1,2-Diphenol
- 芳基氯 Arylchloride
- 芳基氟 Arylfluoride
- 芳基溴 Arylbromide
- 芳基碘 Aryliodide
- 硫酚 Arylthiol
- 氮杂芳香环 Iminoarene
- 氧杂芳香环 Oxoarene
- 硫杂芳香环 Thioarene
- 芳环上有含氢碱性氮原子 Hetero N basic H
- 芳环上有不含氢碱性氮原子 Hetero N basic no H
- 芳环上有非碱性氮原子 Hetero N nonbasic
- 芳环上有氧原子 Hetero O
- 芳环上有硫原子 Hetero S
- 含杂原子芳香化合物 Heteroaromatic
Part II: 氮，硫，磷，硅，硼原子 N, S, P, Si, B
- II.1 氮 Nitrogen
- 亚硝酸盐 Nitrite
- 硫代亚硝酸盐 Thionitrite
- 硝酸盐 Nitrate
- 硝基 Nitro
- 亚硝基 Nitroso
- 叠氮化合物 Azide
- 酰叠氮 Acylazide
- 重氮基 Diazo
- 重氮盐 Diazonium
- 亚硝胺 Nitrosamine
- 亚硝酰胺 Nitrosamide
- 氧化胺 N-Oxide
- 肼 Hydrazine
- 腙 Hydrazone
- 羟胺 Hydroxylamine
- II.2 硫 Sulfur
- 砜 Sulfon
- 亚砜 Sulfoxide
- 锍盐 Sulfonium
- 硫酸 Sulfuric acid
- 硫酸单酯 Sulfuric monoester
- 硫酸二酯 Sulfuric diester
- 硫酸单酰胺 Sulfuric monoamide
- 硫酸双酰胺 Sulfuric diamide
- 硫酸单酰胺酯 Sulfuric esteramide
- 硫酸衍生物 Sulfuric derivative
- 磺酸 Sulfonic acid
- 磺酰胺 Sulfonamide
- 磺酸酯 Sulfonic ester
- 磺酰卤 Sulfonic halide
- 磺酸衍生物 Sulfonic derivative
- 亚磺酸 Sulfinic acid
- 亚磺酰胺 Sulfinic amide
- 亚磺酸酯 Sulfinic ester
- 亚磺酰卤 Sulfinic halide
- 亚磺酸衍生物 Sulfinic derivative
- 次磺酸 Sulfenic acid
- 次磺酰胺 Sulfenic amide
- 次磺酸酯 Sulfenic ester
- 次磺酰卤 Sulfenic halide
- 次磺酸衍生物 Sulfenic derivative
- II.3 磷 Phosphorous
- 膦 Phosphine
- 氧化膦 Phosphine oxide
- 鏻盐 Phosphonium
- 磷酰基 Phosphorylen
- 膦酸 Phosphonic acid
- 膦酸单酯 Phosphonic monoester
- 膦酸双酯 Phosphonic diester
- 膦酸单酰胺 Phosphonic monoamide
- 膦酸双酰胺 Phosphonic diamide
- 膦酸单酰胺酯 Phosphonic esteramide
- 膦酸衍生物 Phosphonic acid derivative
- 磷酸 Phosphoric acid
- 磷酸单酯 Phosphoric monoester
- 磷酸双酯 Phosphoric diester
- 磷酸三酯 Phosphoric triester
- 磷酸单酰胺 Phosphoric monoamide
- 磷酸双酰胺 Phosphoric diamide
- 磷酸三酰胺 Phosphoric triamide
- 膦酸单酯单酰胺 Phosphoric monoestermonoamide
- 膦酸双酯单酰胺 Phosphoric diestermonoamide
- 膦酸单酯双酰胺 Phosphoric monoesterdiamide
- 磷酸衍生物 Phosphoric acid derivative
- 次膦酸 Phosphinic acid
- 次膦酸酯 Phosphinic ester
- 次膦酸酰胺 Phosphinic amide
- 次膦酸 Phosphinic acid derivative
- 亚膦酸 Phosphonous acid
- 亚膦酸单酯 Phosphonous monoester
- 亚膦酸双酯 Phosphonous diester
- 亚膦酸单酰胺 Phosphonous monoamide
- 亚膦酸双酰胺 Phosphonous diamide
- 亚膦酸单酰胺酯 Phosphonous esteramide
- 亚膦酸衍生物 Phosphonous derivatives
- 三价膦酸 Phosphinous acid
- 三价膦酸酯 Phosphinous ester
- 三价膦酸酰胺 Phosphinous amide
- 三价膦酸衍生物 Phosphinous derivatives
- II.4 硅 Silicon
- 四取代硅烷（全取代） Quart silane
- 非四级硅烷（含氢原子） Non-quart silane
- 单卤代硅烷 Silylmonohalide
- 单杂三烷基硅烷 Het trialkylsilane
- 二杂二烷基硅烷 Dihet dialkylsilane
- 三杂单烷基硅烷 Trihet alkylsilane
- 硅酸衍生物 Silicic acid derivative
- II.5 硼 Boron
- 三烷基硼烷 Trialkylborane
- 硼酸衍生物 Boric acid derivatives
- 一烃基硼酸衍生物 Boronic acid derivative
- 硼氢化物 Borohydride
- 四取代硼原子 Quaternary boron
Part III: 特殊结构特征 Some Special Patterns
- III.1 链状结构 Chains
- III.2 环状结构 Rings
- 芳香环 Aromatic
- 杂环 Heterocyclic
- 环氧化合物 Epoxide
- 氮杂环丙烷 NH aziridine
- 螺环 Spiro
- 并环 Annelated rings
- 桥环 Bridged rings
- III.3 糖、核苷/核苷酸，甾族化合物 Sugars and Nucleosides/Nucleotides, Steroids
- 糖，含至少一个氧原子以及一个（五员环）或两个（六员环）氧取代基 Sugar pattern 1
- 糖，含至少一个氧原子以及2位上的缩醛键 Sugar pattern 2
- 糖，以上两种的并集 Sugar pattern combi
- 还原性糖（半缩醛） Sugar pattern 2 reducing
- 还原性糖（alpha构型） Sugar pattern 2 alpha
- 还原性糖（beta构型） Sugar pattern 2 beta
- III.4 其他结构特征 Everything else...
- 共轭双键 Conjugated double bond
- 共轭三键 Conjugated tripple bond
- 顺式双键 Cis double bond
- 反式双键 Trans double bond
- 混合酸酐 Mixed anhydrides
- 卤代杂原子 Halogen on hetero
- 卤素多取代 Halogen multi subst
- 三氟甲基 Trifluoromethyl
- 碳-氧、氮、硫键 C ONS bond
- 带电荷 Charged
- 阴离子 Anion
- 阳离子 Kation
- 盐 Salt
- 1,3互变异构 1,3-Tautomerizable
- 1,5互变异构 1,5-Tautomerizable
- 带自由旋转化学键 Rotatable bond
- Michael加成受体 Michael acceptor
- 偶氮二羧酸衍生物 Dicarbodiazene
- 酸性C-H CH-acidic
- 强酸性C-H CH-acidic strong
- 有手性中心 Chiral center specified
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